真空濾油機控制系統分為手動模式下（PLC版）和自動模式下（PLC版），其控制邏輯也有不同。

手動模式下（PLC版） 

當觸摸“真空泵開”按鈕，真空泵啟動、相應的指示燈亮；觸摸“真空泵關”，真空泵停止運行、指示燈滅。

觸摸“進油泵開”按鈕，進油泵開始啟動、相應的指示燈亮；觸摸“進油泵關”，進油泵停止運行、指示燈滅。當油位上升至高液位時停止正在運行的進油泵自動停止工作。

在進油電磁閥工作，觸摸“加熱開”按鈕，加熱器啟動、相應的指示燈亮；觸摸“加熱器關”，加熱器停止運行、指示燈滅；當加熱運行溫度超過設定溫度，停止加熱；當溫度下降至回差溫度設定值，加熱器又重新啟動運行，這樣周而復始地工作。

正在運行的加熱器，如果遇進油泵停止工作，加熱器停止自動工作。

自動模式下（PLC版） 

觸摸“自動開”按鈕，真空濾油機設備啟動運行：

a. 真空泵啟動；真空泵觸發

b. 進油電磁閥控制：真空泵啟動后自動檢測油位，如果低于中液位，打開進油電磁閥，隨著油位上升至高液位時進油泵、進油電磁閥停止工作，這樣周而復始的工作；

c. 加熱器控制：進油電磁閥啟動后；檢測油溫，低于回差溫度（參數可設置）加熱；高于設定溫度（參數可設置）停止加熱，這樣周而復始地工作；進油電磁閥停止工作，加熱器也停止工作；

d. 出油泵控制：開機后檢測油位，如果油液至中液位開關，打開出油電磁閥（客戶自裝），出油泵工作，隨著油位下降至低液位時，出油泵、出油電磁閥停止工作，這樣周而復始的工作。

報警說明：

無論在任何模式下運行，遭遇報警觸發，設備會立即停止工作，聲光報警運行，同時在觸摸屏彈出“故障指示”界面，顯示報警信息：觸發時間、報警源（出油壓力、熱繼電器、相序繼電器）；報警復位的方法，關閉面板控制電源，處理相應的報警問題后重新上電；

急停操作：

真空濾油機運行過程中如遇漏油、電機異響等情況，按下面板上的急停開關，設備立即停止工作；復位的方法，關閉面板控制電源，右旋急停開關，重新上電。